Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
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SGCBQ16585 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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