Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDB1Q16531 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
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DDB1Q16531 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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DDB1Q16531 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
DDB1Q16531 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
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