Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PDE3BQ13370 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PDE3BQ13370 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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