Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDE3BQ13370 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.2 ms