Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN9

TRAPPC13, Trafficking protein particle complex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13A5PLN9 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.09□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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