Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SGCBQ16585 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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