Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CNN3Q15417 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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