Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PDE3BQ13370 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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