Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
PTPN13Q12923 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
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