Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
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SGCAQ16586 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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SGCAQ16586 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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SGCAQ16586 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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SGCAQ16586 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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SGCAQ16586 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SGCAQ16586 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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