Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCBQ16585 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCBQ16585 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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