Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIK3Q13003 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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