Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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