Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD12P35452 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD12P35452 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD12P35452 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD12P35452 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD12P35452 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD12P35452 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD12P35452 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD12P35452 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD12P35452 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD12P35452 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD12P35452 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD12P35452 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD12P35452 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD12P35452 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD12P35452 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD12P35452 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD12P35452 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD12P35452 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD12P35452 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD12P35452 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD12P35452 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD12P35452 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXD12P35452 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD12P35452 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD12P35452 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD12P35452 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD12P35452 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD12P35452 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD12P35452 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD12P35452 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD12P35452 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD12P35452 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD12P35452 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD12P35452 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD12P35452 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD12P35452 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD12P35452 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXD12P35452 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXD12P35452 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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