Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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SNX13Q9Y5W8 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
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SNX13Q9Y5W8 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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SNX13Q9Y5W8 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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