Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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SQSTM1Q13501 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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SQSTM1Q13501 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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SQSTM1Q13501 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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