Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NRF1Q16656 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 427.4 ms