Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SSPNQ14714 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SSPNQ14714 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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