Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNX13Q9Y5W8 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218.8 ms