Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUF6

LINC00336, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00336, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00336Q6ZUF6 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00336Q6ZUF6 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00336Q6ZUF6 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00336Q6ZUF6 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00336Q6ZUF6 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00336Q6ZUF6 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00336Q6ZUF6 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00336Q6ZUF6 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00336Q6ZUF6 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00336Q6ZUF6 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00336Q6ZUF6 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00336Q6ZUF6 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00336Q6ZUF6 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00336Q6ZUF6 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LINC00336Q6ZUF6 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.25
LINC00336Q6ZUF6 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
LINC00336Q6ZUF6 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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