Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
DDB1Q16531 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DDB1Q16531 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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