Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXD4Q12950 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXD4Q12950 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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