Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRAP18433 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRAP18433 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRAP18433 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRAP18433 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRAP18433 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRAP18433 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRAP18433 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRAP18433 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRAP18433 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRAP18433 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRAP18433 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRAP18433 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRAP18433 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRAP18433 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRAP18433 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRAP18433 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRAP18433 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRAP18433 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRAP18433 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRAP18433 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRAP18433 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRAP18433 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRAP18433 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRAP18433 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRAP18433 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRAP18433 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRAP18433 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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PTPRAP18433 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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PTPRAP18433 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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PTPRAP18433 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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PTPRAP18433 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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PTPRAP18433 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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PTPRAP18433 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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PTPRAP18433 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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PTPRAP18433 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRAP18433 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
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