Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNN3Q15417 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
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