Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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