Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.4 ms