Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
COL9A2Q14055 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL9A2Q14055 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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