Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD12P35452 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD12P35452 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD12P35452 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD12P35452 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD12P35452 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD12P35452 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD12P35452 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD12P35452 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD12P35452 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
HOXD12P35452 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXD12P35452 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD12P35452 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD12P35452 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD12P35452 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD12P35452 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD12P35452 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD12P35452 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD12P35452 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD12P35452 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXD12P35452 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD12P35452 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD12P35452 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD12P35452 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD12P35452 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXD12P35452 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HOXD12P35452 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD12P35452 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD12P35452 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD12P35452 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD12P35452 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD12P35452 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD12P35452 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD12P35452 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD12P35452 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXD12P35452 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD12P35452 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD12P35452 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD12P35452 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD12P35452 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD12P35452 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD12P35452 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD12P35452 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD12P35452 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD12P35452 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD12P35452 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXD12P35452 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD12P35452 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD12P35452 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXD12P35452 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD12P35452 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD12P35452 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD12P35452 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD12P35452 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HOXD12P35452 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD12P35452 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD12P35452 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD12P35452 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD12P35452 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD12P35452 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD12P35452 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD12P35452 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD12P35452 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD12P35452 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD12P35452 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD12P35452 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD12P35452 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD12P35452 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD12P35452 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD12P35452 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD12P35452 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD12P35452 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD12P35452 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD12P35452 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD12P35452 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD12P35452 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD12P35452 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD12P35452 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD12P35452 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
HOXD12P35452 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HOXD12P35452 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HOXD12P35452 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD12P35452 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD12P35452 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD12P35452 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD12P35452 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD12P35452 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD12P35452 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD12P35452 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD12P35452 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
HOXD12P35452 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD12P35452 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
HOXD12P35452 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD12P35452 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD12P35452 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD12P35452 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD12P35452 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD12P35452 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD12P35452 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD12P35452 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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