Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.02□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
DDX39BQ13838 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
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