Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXD4Q12950 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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