Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
DDX39BQ13838 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.8 ms