Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNTA1Q13424 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SNTA1Q13424 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SNTA1Q13424 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNTA1Q13424 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNTA1Q13424 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNTA1Q13424 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SNTA1Q13424 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SNTA1Q13424 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNTA1Q13424 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNTA1Q13424 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNTA1Q13424 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNTA1Q13424 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNTA1Q13424 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNTA1Q13424 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNTA1Q13424 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SNTA1Q13424 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SNTA1Q13424 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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SNTA1Q13424 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
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SNTA1Q13424 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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SNTA1Q13424 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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SNTA1Q13424 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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SNTA1Q13424 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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SNTA1Q13424 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
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SNTA1Q13424 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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SNTA1Q13424 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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SNTA1Q13424 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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SNTA1Q13424 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNTA1Q13424 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
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