Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KLF9Q13886 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KLF9Q13886 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KLF9Q13886 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KLF9Q13886 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KLF9Q13886 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KLF9Q13886 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
KLF9Q13886 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KLF9Q13886 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KLF9Q13886 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KLF9Q13886 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KLF9Q13886 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KLF9Q13886 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KLF9Q13886 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
KLF9Q13886 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KLF9Q13886 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KLF9Q13886 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KLF9Q13886 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KLF9Q13886 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KLF9Q13886 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KLF9Q13886 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KLF9Q13886 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KLF9Q13886 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KLF9Q13886 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
KLF9Q13886 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KLF9Q13886 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KLF9Q13886 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KLF9Q13886 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KLF9Q13886 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KLF9Q13886 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KLF9Q13886 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KLF9Q13886 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KLF9Q13886 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KLF9Q13886 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KLF9Q13886 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KLF9Q13886 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KLF9Q13886 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KLF9Q13886 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KLF9Q13886 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KLF9Q13886 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KLF9Q13886 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KLF9Q13886 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KLF9Q13886 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KLF9Q13886 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KLF9Q13886 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KLF9Q13886 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KLF9Q13886 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KLF9Q13886 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KLF9Q13886 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KLF9Q13886 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KLF9Q13886 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KLF9Q13886 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KLF9Q13886 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KLF9Q13886 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KLF9Q13886 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KLF9Q13886 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KLF9Q13886 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KLF9Q13886 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KLF9Q13886 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KLF9Q13886 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KLF9Q13886 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KLF9Q13886 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KLF9Q13886 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLF9Q13886 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KLF9Q13886 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLF9Q13886 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLF9Q13886 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KLF9Q13886 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLF9Q13886 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLF9Q13886 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLF9Q13886 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLF9Q13886 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLF9Q13886 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLF9Q13886 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KLF9Q13886 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLF9Q13886 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLF9Q13886 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLF9Q13886 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLF9Q13886 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLF9Q13886 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLF9Q13886 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KLF9Q13886 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLF9Q13886 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KLF9Q13886 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KLF9Q13886 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KLF9Q13886 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLF9Q13886 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KLF9Q13886 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KLF9Q13886 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLF9Q13886 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLF9Q13886 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLF9Q13886 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLF9Q13886 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLF9Q13886 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KLF9Q13886 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KLF9Q13886 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KLF9Q13886 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KLF9Q13886 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KLF9Q13886 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KLF9Q13886 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188 ms