Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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FOXD4Q12950 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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