Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
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