Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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FOXD4Q12950 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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FOXD4Q12950 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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FOXD4Q12950 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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FOXD4Q12950 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
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FOXD4Q12950 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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FOXD4Q12950 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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FOXD4Q12950 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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FOXD4Q12950 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
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FOXD4Q12950 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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FOXD4Q12950 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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FOXD4Q12950 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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FOXD4Q12950 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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FOXD4Q12950 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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