Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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