Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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SQSTM1Q13501 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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