Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SQSTM1Q13501 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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