Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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PTPN13Q12923 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
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PTPN13Q12923 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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PTPN13Q12923 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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PTPN13Q12923 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
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PTPN13Q12923 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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PTPN13Q12923 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPN13Q12923 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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