Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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FOXD4Q12950 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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FOXD4Q12950 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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FOXD4Q12950 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
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FOXD4Q12950 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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FOXD4Q12950 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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FOXD4Q12950 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
FOXD4Q12950 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
FOXD4Q12950 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
FOXD4Q12950 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXD4Q12950 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXD4Q12950 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXD4Q12950 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXD4Q12950 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXD4Q12950 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXD4Q12950 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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