Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SQSTM1Q13501 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SQSTM1Q13501 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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