Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pacs2Q3V3Q7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pacs2Q3V3Q7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pacs2Q3V3Q7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pacs2Q3V3Q7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pacs2Q3V3Q7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pacs2Q3V3Q7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pacs2Q3V3Q7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pacs2Q3V3Q7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pacs2Q3V3Q7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pacs2Q3V3Q7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Pacs2Q3V3Q7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Pacs2Q3V3Q7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Pacs2Q3V3Q7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Pacs2Q3V3Q7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms