Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms