Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5cP41230 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5cP41230 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5cP41230 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5cP41230 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5cP41230 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5cP41230 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5cP41230 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5cP41230 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5cP41230 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5cP41230 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5cP41230 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5cP41230 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5cP41230 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5cP41230 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5cP41230 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5cP41230 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5cP41230 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5cP41230 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5cP41230 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5cP41230 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5cP41230 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms