Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnga1P29974 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnga1P29974 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms