Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Efna3O08545 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Efna3O08545 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Efna3O08545 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Efna3O08545 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Efna3O08545 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Efna3O08545 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Efna3O08545 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Efna3O08545 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Efna3O08545 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Efna3O08545 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Efna3O08545 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Efna3O08545 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Efna3O08545 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Efna3O08545 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Efna3O08545 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Efna3O08545 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Efna3O08545 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Efna3O08545 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Efna3O08545 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Efna3O08545 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Efna3O08545 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Efna3O08545 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Efna3O08545 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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