Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNN3Q15417 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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