Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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GRIK3Q13003 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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GRIK3Q13003 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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GRIK3Q13003 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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GRIK3Q13003 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK3Q13003 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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