Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
SQSTM1Q13501 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SQSTM1Q13501 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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